Where is Knutie?


(english) I [heart] Nature
December 21, 2008, 3:55 am
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It’s done. Katja, Tobi, Andreas & me worked hard for that but finally submitted our 22 pages Nature Protocols paper in time.

Check out the corresponding project at http://www.coryneregnet.de.

To give you an impression on how it all started: Here is the scratch paper that we used for our diskussions during the first few days.

front side of our scratch paper

front side of our scratch paper

back side of our scratch paper

back side of our scratch paper

And that’s where the whole thing started here in lovely Cal (Grizzly Peak in Berkeley):

Grizzly Peak Berkeley

Grizzly Peak Berkeley

If this brilliant piece of science is not being accepted, that’s how the whole thing will end. ;-)

Me and the Stanford axe in my backyard.

Me and the Stanford axe in my backyard.

Anyways… Please help us and

KEEP

YOUR

FINGERS

CROSSED!

I’m out… Will see most of you in lovely NYC!!



(english) California Winter Dreamin’
December 15, 2008, 2:54 pm
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California Winter Day Dreamin’

It shouldn’t rain in California. At least rain could be warm.

Thank god it’s neither freezing nor do we face a storm.

Can’t wait to see my sweet heart. Can wait to have her here.

We’ll start with Xmas in New York, oh Birte, you my dear.

Soon I’ll leave my Cal, my buddies, and pacific sea.

But together we will slide into 2009, on a boat in N Y C.

Once back in Cal, in the town that stole my heart,

in San Fran, in the bay, a funny next year will start!

However, I love the time here with you.

We need more people from the Mission, from Bielefeld, Hamburg, and Munich too.

(Knut, December 15th 2008)



(english) It is done.
November 30, 2008, 7:26 pm
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It is done. My first invited paper has finally been accepted for publication in Briefings in Bioinformatics. *jippie* It is a special honor for me since I have been invited to contribute with a technology overview and review for my area of bioinformatics research.

Please cite the following whenever you can. ;-)

Baumbach J, Rahmann S, Tauch A (2008) Towards the integrated analysis, visualization, and reconstruction of microbial gene regulatory networks. Briefings in Bioinformatics (accepted for publication).

Thanks to my co-authors!

CoryneRegNet comes of age

CoryneRegNet growing



37 : 16
November 30, 2008, 6:52 pm
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GO BEARS

GO BEARS

Die Axt

Und es begab sich im Jahre 1899… Während eines Wettkampfes im schönen San Francisco, schlichen sich gewitzte Cal-Studenten aus Berkeley ins Stanford-Lager und entwendeten eine wertvolle Axt aus den Reihen der rot-weiß getünchten Stanford’ler. Diese Axt sollte fortan als Trophähe in den Schränken der Studentverbindungen im schönen, sonnigen Berkeley ihre Zeit mit angestarrt & angebetet werden verbringen. So zumindest der Plan der tapferen blau-gelben. Mit vor Trauer verlaufener rot-weisser Schminke hörten einige Studenten aus Stanford auf um ihren Baum zu tanzen und machten sich auf die Jagd ihr Eigentum zurückzuholen. Sogar die örtlichen Sicherheitskräfte wurden eingeschaltet um sich an der Suche zu beteiligen. Alle Fähren nach Oakland und Berkeley sollten durchsucht werden auf der Suche nach dem einzigen Gegenstand, der einem echten Baum (immerhin das Stanford-Maskottchen) gefährlich werden kann: der Axt. Und beinahe wäre dieser geschickte Schachzug der Cal-Bears auch vereitelt worden… Aber ein junges Fräulein am Ferrybuilding, unerschütterlich in ihrer Loyalität zu den Bears, schmuggelte die Axt in ihrem weiten Rock über die Bucht bis nach Berkeley.

Von diesem Tag an entbrandten wilde Kämpfe um die Axt zwischen Berkeley und Stanford, zwischen den blau-gelben aus der East Bay und den rot-weissen aus dem Valley. Als es selbst den beteiligten Studentenverbindungen zu bunt wurde, hat man sich großzügig auf ein unentschieden geeinigt und die Axt als Siegespokal des jährlichen Big Games zwischen den Bären und den Bäumen auserkoren.

So oder so ähnlich wird es sich damals zugetragen haben und hier kann das Ganze nocheinmal etwas ausführlicher nachgelesen werden: The Axe Story.

Dieses Jahr ist das 111te Big Game in Berkeley, die Axt ist in Stanford, und wir waren live im Stadion dabei, als versucht wurde, dieses edle Stück zurück in die Bay zu holen… (more…)



(english) Est. 1214 – Kehrpaket
November 12, 2008, 7:55 pm
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Est 1214 – I’ll wear it with pride and honor!

bielefeld2

There is nothing better than “Niederegger Marzipan Schwarzbrot” out there.

THANKS GUYS!!!

Gretaz from the west coast to lovely Bielefeld!



For the [PBS] crow
November 11, 2008, 5:26 am
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Nerdish by nature vs. Dorkness rising

pbs_wallpaper2

“Weil wir den Bogen raus haben, wie G’raden.”

(more…)



(english) HISTORY REPEATING – The Bay Area prepares for an event of epic proportions: 10 days until T MASTER T
November 6, 2008, 3:51 pm
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T Master T safeguards the Golden Gate Bridge

T Master T safeguards the Golden Gate Bridge

Unnecessary to introduce the T Master T aka Tobi aka Orko.

Still wanna know (more…)



Historische Momente – Barack Obama ist der nächste Präsident der USA
November 6, 2008, 2:43 pm
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Ein historischer Moment und ich war dabei. Juchhu! Da die Wahllokale hier wg. den 3 Zeitzonen, die Amerika hat recht versetzt schliessen, kann man an der Westküste im Prinzip von 17.00 bis mind. 21.00 die ganzen Hochrechnungen und Ergebnisse nachvollziehen.

Das Ganze nennt man dann “election party” und ist jeh nachdem, wen man favourisiert hat, eine lustige oder nervige Angelegenheit. Im Wesentlichen kommt es ja auf die sog. swing states (Florida, Ohio, etc.) an, und das kann dann auch zusätzlich noch recht spannend werden, weil diese erst relativ spät sichere Hochrechnung haben, obwohl sie eher östlich liegen.

Wir haben zunächst im Tripple rock die Wahl verfolgt. War eine ganz lustige Angelegenheit. Jeder blaue (democrats) Bundestaat wird laut bejubelt, jeder rote (republicans) ausgebuuht.

Als dann klar war, dass “der Drops gelutscht” ist und Obama die Sache in der Tasche hat, ging hier im liberalen Berkeley natürlich die Post ab: (more…)



(english) Halloween in Santa Baraba
November 6, 2008, 1:59 pm
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Joe the Plumber

Joe the plumber

Background

Ok guys… Some of us DO celebrate Halloween in Germany. People do it in the UK… But damn… They REALLY celebrate Halloween here.

And since Halloween is an important American holiday, and since we are always interested in clutural exchange (as stated in my US visa “for research and cultural exchange” :) ), we decided to road trip south to the probably biggest Halloween party in the world, to

SANTA BARBARA

The UCSB (University of California, Santa Barbara or University of Casual Sex and Beer) is located south of San Fran not far north of Los Angeles. Since it’s “slightly” warmer down there, most “students” live in a little village nearby the UC called Isla Visa (short I.V. or HIV ;-) ). Why is that? Easy… It’s hard to carry your surfboard with your bike all the way down from Santa Barbara to the beach. Solution: live right next to the beach (Del Playa, Google maps).

Well. Our little research team (consisting of 4 guys and me) made the way to IV to evaluate the effect of alcohol to american college kids. See what happened…

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Der mit dem Bär tanzt – One night @ Yosemite park
November 6, 2008, 4:16 am
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Yosemite park, camp curry

Yosemite park, camp curry

Die Landschaft von Yosemite ist unglaublich. Ich dachte ich bin in einem Hollywood-Film. Ca. 5h mit dem Auto (auf deutschen Autobahnen währens nur 3h gewesen ;-) ) von San Fran entfernt liegt das Camp Curry mitten in Yosemite park (auch Curry Village genannt; Google maps). Dort sind wir mal hingefahren um zu evaluieren ob an dem Gerücht mit den freilebenden Bären wirklich was dran ist… (more…)




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